Auch die Sonderausstellungen - sei es die Krippenausstellung zur Weihnachtszeit, seien es Ausstellungen, die lokalen Künstlerinnen und Künstlern eine Plattform bieten, seien es Ausstellungen, die die Inhalte der Sammlungen vertiefen und die regelmäßig für Aufsehen sorgen - und die vielen Aktivitäten tragen dazu bei, dass das Museum der Stadt Bad Ischl ein unverwechselbares Programm präsentieren kann.